Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp9yF8VPU6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms