Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Defa35E9QLQ1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa35E9QLQ1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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