Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Zbed5B2RPU8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms