Protein–RNA interactions for Protein: B1AWC9

Pde4b, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4bB1AWC9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde4bB1AWC9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms