Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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CcniQ9Z2V9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CcniQ9Z2V9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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