Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Crlf3Q9Z2L7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Crlf3Q9Z2L7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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