Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scamp5Q9JKD3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms