Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vmn1r46Q9EQ45 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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