Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tspan4Q9DCK3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tspan4Q9DCK3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms