Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms