Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D9D9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D9D9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms