Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc94Q9D6J3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms