Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm3404Q9D506 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms