Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pramef12Q9D2F1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms