Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Trappc6bQ9D289 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Trappc6bQ9D289 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Trappc6bQ9D289 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc6bQ9D289 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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