Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc47Q9D024 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc47Q9D024 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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