Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Snf8Q9CZ28 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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