Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CWU4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms