Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pard3bQ9CSB4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms