Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Tmed6Q9CQG0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Tmed6Q9CQG0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tmed6Q9CQG0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Tmed6Q9CQG0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Tmed6Q9CQG0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Tmed6Q9CQG0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Tmed6Q9CQG0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Tmed6Q9CQG0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tmed6Q9CQG0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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