Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CPS8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms