Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
SptssbQ925E8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms