Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Csmd1Q923L3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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