Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf7Q922B6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms