Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smc1bQ920F6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smc1bQ920F6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smc1bQ920F6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Smc1bQ920F6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smc1bQ920F6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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