Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Uhrf1Q8VDF2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Uhrf1Q8VDF2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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