Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cdk8Q8R3L8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdk8Q8R3L8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms