Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc12Q8K2L8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc12Q8K2L8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms