Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Parp9Q8CAS9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms