Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Bhlhe22Q8C6A8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms