Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccser1Q8C0C4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccser1Q8C0C4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccser1Q8C0C4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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