Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Ctdsp2Q8BX07 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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