Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
TtpaQ8BWP5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TtpaQ8BWP5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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TtpaQ8BWP5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TtpaQ8BWP5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms