Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pggt1bQ8BUY9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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