Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp1Q8BJQ2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp1Q8BJQ2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms