Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ubash3bQ8BGG7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms