Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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