Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp8b3Q6UQ17 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Atp8b3Q6UQ17 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms