Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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NipblQ6KCD5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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NipblQ6KCD5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
NipblQ6KCD5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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