Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms