Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc6a4Q60857 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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