Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rhox3aQ4TU90 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms