Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ctdnep1Q3TP92 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ctdnep1Q3TP92 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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