Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RubcnlQ3TD16 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms