Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Traf3ip1Q149C2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Traf3ip1Q149C2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf3ip1Q149C2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms