Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rundc1Q0VDN7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms