Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntnap5bQ0V8T8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms