Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC18.96■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms