Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
NrepQ07475 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms