Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pax5Q02650 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms